Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
STX4Q12846 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
STX4Q12846 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
STX4Q12846 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
STX4Q12846 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
STX4Q12846 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
STX4Q12846 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
STX4Q12846 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
STX4Q12846 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
STX4Q12846 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
STX4Q12846 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
STX4Q12846 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
STX4Q12846 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
STX4Q12846 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
STX4Q12846 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
STX4Q12846 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
STX4Q12846 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
STX4Q12846 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
STX4Q12846 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
STX4Q12846 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
STX4Q12846 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
STX4Q12846 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
STX4Q12846 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
STX4Q12846 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
STX4Q12846 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
STX4Q12846 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
STX4Q12846 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
STX4Q12846 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
STX4Q12846 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
STX4Q12846 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
STX4Q12846 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
STX4Q12846 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
STX4Q12846 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
STX4Q12846 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
STX4Q12846 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
STX4Q12846 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
STX4Q12846 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
STX4Q12846 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
STX4Q12846 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
STX4Q12846 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
STX4Q12846 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
STX4Q12846 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
STX4Q12846 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
STX4Q12846 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
STX4Q12846 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
STX4Q12846 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
STX4Q12846 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
STX4Q12846 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
STX4Q12846 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
STX4Q12846 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
STX4Q12846 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
STX4Q12846 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
STX4Q12846 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
STX4Q12846 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
STX4Q12846 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
STX4Q12846 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
STX4Q12846 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
STX4Q12846 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
STX4Q12846 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
STX4Q12846 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
STX4Q12846 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
STX4Q12846 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
STX4Q12846 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
STX4Q12846 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
STX4Q12846 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
STX4Q12846 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
STX4Q12846 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
STX4Q12846 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
STX4Q12846 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
STX4Q12846 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
STX4Q12846 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
STX4Q12846 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
STX4Q12846 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
STX4Q12846 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
STX4Q12846 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
STX4Q12846 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
STX4Q12846 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
STX4Q12846 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
STX4Q12846 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
STX4Q12846 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
STX4Q12846 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
STX4Q12846 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
STX4Q12846 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
STX4Q12846 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
STX4Q12846 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
STX4Q12846 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
STX4Q12846 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
STX4Q12846 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
STX4Q12846 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
STX4Q12846 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
STX4Q12846 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
STX4Q12846 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
STX4Q12846 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
STX4Q12846 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
STX4Q12846 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
STX4Q12846 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
STX4Q12846 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
STX4Q12846 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
STX4Q12846 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
STX4Q12846 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
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