Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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