Protein–RNA interactions for Protein: Q12391

TY1A-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL1Q12391 RPL25YOL127W 429 nt3.17□□□□□ -1.9
TY1A-NL1Q12391 YOR333CYOR333C 417 nt3.17□□□□□ -1.9
TY1A-NL1Q12391 TCB3YML072C 4638 nt3.17□□□□□ -1.9
TY1A-NL1Q12391 PLC1YPL268W 2610 nt3.17□□□□□ -1.9
TY1A-NL1Q12391 SPB1YCL054W 2526 nt3.17□□□□□ -1.9
TY1A-NL1Q12391 REG1YDR028C 3045 nt3.17□□□□□ -1.9
TY1A-NL1Q12391 PSO2YMR137C 1986 nt3.16□□□□□ -1.9
TY1A-NL1Q12391 FAR1YJL157C 2493 nt3.15□□□□□ -1.9
TY1A-NL1Q12391 NTO1YPR031W 2247 nt3.15□□□□□ -1.9
TY1A-NL1Q12391 ECM12YHR021W-A 456 nt3.15□□□□□ -1.91
TY1A-NL1Q12391 COX19YLL018C-A 297 nt3.15□□□□□ -1.91
TY1A-NL1Q12391 COX14YML129C 213 nt3.15□□□□□ -1.91
TY1A-NL1Q12391 RTC6YPL183W-A 282 nt3.15□□□□□ -1.91
TY1A-NL1Q12391 MET10YFR030W 3108 nt3.15□□□□□ -1.91
TY1A-NL1Q12391 PHO81YGR233C 3537 nt3.15□□□□□ -1.91
TY1A-NL1Q12391 PSK2YOL045W 3306 nt3.14□□□□□ -1.91
TY1A-NL1Q12391 SOK1YDR006C 2706 nt3.14□□□□□ -1.91
TY1A-NL1Q12391 YFL065CYFL065C 309 nt3.14□□□□□ -1.91
TY1A-NL1Q12391 ASG1YIL130W 2895 nt3.14□□□□□ -1.91
TY1A-NL1Q12391 COS111YBR203W 2775 nt3.14□□□□□ -1.91
TY1A-NL1Q12391 EFR3YMR212C 2349 nt3.14□□□□□ -1.91
TY1A-NL1Q12391 YEL025CYEL025C 3567 nt3.13□□□□□ -1.91
TY1A-NL1Q12391 HEF3YNL014W 3135 nt3.13□□□□□ -1.91
TY1A-NL1Q12391 MYO3YKL129C 3819 nt3.13□□□□□ -1.91
TY1A-NL1Q12391 SGD1YLR336C 2700 nt3.13□□□□□ -1.91
TY1A-NL1Q12391 RPL33BYOR234C 324 nt3.13□□□□□ -1.91
TY1A-NL1Q12391 RLI1YDR091C 1827 nt3.13□□□□□ -1.91
TY1A-NL1Q12391 BMS1YPL217C 3552 nt3.13□□□□□ -1.91
TY1A-NL1Q12391 AUS1YOR011W 4185 nt3.13□□□□□ -1.91
TY1A-NL1Q12391 BCH1YMR237W 2175 nt3.12□□□□□ -1.91
TY1A-NL1Q12391 YEL043WYEL043W 2871 nt3.12□□□□□ -1.91
TY1A-NL1Q12391 YJL070CYJL070C 2667 nt3.12□□□□□ -1.91
TY1A-NL1Q12391 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt3.12□□□□□ -1.91
TY1A-NL1Q12391 SSQ1YLR369W 1974 nt3.12□□□□□ -1.91
TY1A-NL1Q12391 MIT1YEL007W 2001 nt3.12□□□□□ -1.91
TY1A-NL1Q12391 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt3.12□□□□□ -1.91
TY1A-NL1Q12391 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt3.12□□□□□ -1.91
TY1A-NL1Q12391 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt3.12□□□□□ -1.91
TY1A-NL1Q12391 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt3.12□□□□□ -1.91
TY1A-NL1Q12391 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt3.12□□□□□ -1.91
TY1A-NL1Q12391 YCL019WYCL019W 5313 nt3.12□□□□□ -1.91
TY1A-NL1Q12391 BAS1YKR099W 2436 nt3.11□□□□□ -1.91
TY1A-NL1Q12391 RRP5YMR229C 5190 nt3.11□□□□□ -1.91
TY1A-NL1Q12391 PHM6YDR281C 315 nt3.11□□□□□ -1.91
TY1A-NL1Q12391 RPS21AYKR057W 264 nt3.11□□□□□ -1.91
TY1A-NL1Q12391 YBL065WYBL065W 345 nt3.11□□□□□ -1.91
TY1A-NL1Q12391 SNT1YCR033W 3681 nt3.11□□□□□ -1.91
TY1A-NL1Q12391 HEH2YDR458C 1992 nt3.11□□□□□ -1.91
TY1A-NL1Q12391 RIX1YHR197W 2292 nt3.1□□□□□ -1.91
TY1A-NL1Q12391 KAP95YLR347C 2586 nt3.1□□□□□ -1.91
TY1A-NL1Q12391 GIS4YML006C 2325 nt3.1□□□□□ -1.91
TY1A-NL1Q12391 ERB1YMR049C 2424 nt3.1□□□□□ -1.91
TY1A-NL1Q12391 ITC1YGL133W 3795 nt3.1□□□□□ -1.91
TY1A-NL1Q12391 TIM11YDR322C-A 291 nt3.1□□□□□ -1.91
TY1A-NL1Q12391 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt3.1□□□□□ -1.91
TY1A-NL1Q12391 YOR218CYOR218C 420 nt3.1□□□□□ -1.91
TY1A-NL1Q12391 VMA9YCL005W-A 222 nt3.1□□□□□ -1.91
TY1A-NL1Q12391 MYO5YMR109W 3660 nt3.1□□□□□ -1.91
TY1A-NL1Q12391 STU2YLR045C 2667 nt3.1□□□□□ -1.91
TY1A-NL1Q12391 VPH1YOR270C 2523 nt3.1□□□□□ -1.91
TY1A-NL1Q12391 RPA135YPR010C 3612 nt3.1□□□□□ -1.91
TY1A-NL1Q12391 PIG1YLR273C 1947 nt3.09□□□□□ -1.91
TY1A-NL1Q12391 PMP2YEL017C-A 132 nt3.09□□□□□ -1.91
TY1A-NL1Q12391 YIR044CYIR044C 186 nt3.09□□□□□ -1.91
TY1A-NL1Q12391 RPS17AYML024W 411 nt3.09□□□□□ -1.91
TY1A-NL1Q12391 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt3.09□□□□□ -1.91
TY1A-NL1Q12391 RPN2YIL075C 2838 nt3.09□□□□□ -1.92
TY1A-NL1Q12391 VPS3YDR495C 3036 nt3.09□□□□□ -1.92
TY1A-NL1Q12391 BOI1YBL085W 2943 nt3.08□□□□□ -1.92
TY1A-NL1Q12391 SPO21YOL091W 1830 nt3.08□□□□□ -1.92
TY1A-NL1Q12391 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt3.08□□□□□ -1.92
TY1A-NL1Q12391 YOR345CYOR345C 351 nt3.08□□□□□ -1.92
TY1A-NL1Q12391 INP2YMR163C 2118 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1A-NL1Q12391 USE1YGL098W 738 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1A-NL1Q12391 MCM10YIL150C 1716 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1A-NL1Q12391 CLN3YAL040C 1743 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1A-NL1Q12391 BRP1YGL007W 378 nt3.06□□□□□ -1.92
TY1A-NL1Q12391 VPS53YJL029C 2469 nt3.06□□□□□ -1.92
TY1A-NL1Q12391 ZDS2YML109W 2829 nt3.06□□□□□ -1.92
TY1A-NL1Q12391 PTC5YOR090C 1719 nt3.06□□□□□ -1.92
TY1A-NL1Q12391 TFC8YPL007C 1767 nt3.06□□□□□ -1.92
TY1A-NL1Q12391 MPH1YIR002C 2982 nt3.06□□□□□ -1.92
TY1A-NL1Q12391 GCN1YGL195W 8019 nt3.05□□□□□ -1.92
TY1A-NL1Q12391 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt3.05□□□□□ -1.92
TY1A-NL1Q12391 YJL022WYJL022W 309 nt3.05□□□□□ -1.92
TY1A-NL1Q12391 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt3.05□□□□□ -1.92
TY1A-NL1Q12391 GRX8YLR364W 330 nt3.05□□□□□ -1.92
TY1A-NL1Q12391 LSM7YNL147W 348 nt3.05□□□□□ -1.92
TY1A-NL1Q12391 SQS1YNL224C 2304 nt3.05□□□□□ -1.92
TY1A-NL1Q12391 NOP4YPL043W 2058 nt3.05□□□□□ -1.92
TY1A-NL1Q12391 POM152YMR129W 4014 nt3.05□□□□□ -1.92
TY1A-NL1Q12391 SIZ1YDR409W 2715 nt3.05□□□□□ -1.92
TY1A-NL1Q12391 NUP120YKL057C 3114 nt3.04□□□□□ -1.92
TY1A-NL1Q12391 DBP7YKR024C 2229 nt3.04□□□□□ -1.92
TY1A-NL1Q12391 PUF4YGL014W 2667 nt3.04□□□□□ -1.92
TY1A-NL1Q12391 MPT5YGL178W 2580 nt3.04□□□□□ -1.92
TY1A-NL1Q12391 RAD2YGR258C 3096 nt3.04□□□□□ -1.92
TY1A-NL1Q12391 PDR12YPL058C 4536 nt3.03□□□□□ -1.92
TY1A-NL1Q12391 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt3.03□□□□□ -1.92
TY1A-NL1Q12391 IES6YEL044W 501 nt3.03□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27.9 ms