Protein–RNA interactions for Protein: Q12347

HRT3, F-box protein HRT3, yeastyeast

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRT3Q12347 YIL166CYIL166C 1629 nt2.09□□□□□ -2.07
HRT3Q12347 APC2YLR127C 2562 nt2.09□□□□□ -2.07
HRT3Q12347 SCH9YHR205W 2475 nt2.09□□□□□ -2.07
HRT3Q12347 YNL146WYNL146W 303 nt2.09□□□□□ -2.07
HRT3Q12347 YOR121CYOR121C 306 nt2.09□□□□□ -2.07
HRT3Q12347 RLF2YPR018W 1821 nt2.09□□□□□ -2.08
HRT3Q12347 YSW1YBR148W 1830 nt2.09□□□□□ -2.08
HRT3Q12347 DIE2YGR227W 1578 nt2.09□□□□□ -2.08
HRT3Q12347 SPC72YAL047C 1869 nt2.09□□□□□ -2.08
HRT3Q12347 GNT1YOR320C 1476 nt2.08□□□□□ -2.08
HRT3Q12347 PEX8YGR077C 1770 nt2.08□□□□□ -2.08
HRT3Q12347 FKS1YLR342W 5631 nt2.08□□□□□ -2.08
HRT3Q12347 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt2.08□□□□□ -2.08
HRT3Q12347 YRB1YDR002W 606 nt2.08□□□□□ -2.08
HRT3Q12347 YER076W-AYER076W-A 348 nt2.08□□□□□ -2.08
HRT3Q12347 RTT102YGR275W 474 nt2.08□□□□□ -2.08
HRT3Q12347 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt2.08□□□□□ -2.08
HRT3Q12347 YML009C-AYML009C-A 327 nt2.08□□□□□ -2.08
HRT3Q12347 COX7YMR256C 183 nt2.08□□□□□ -2.08
HRT3Q12347 PSK2YOL045W 3306 nt2.08□□□□□ -2.08
HRT3Q12347 YJR098CYJR098C 1971 nt2.07□□□□□ -2.08
HRT3Q12347 SWA2YDR320C 2007 nt2.07□□□□□ -2.08
HRT3Q12347 YGR035CYGR035C 351 nt2.07□□□□□ -2.08
HRT3Q12347 HYR1YIR037W 492 nt2.07□□□□□ -2.08
HRT3Q12347 RPL40BYKR094C 387 nt2.07□□□□□ -2.08
HRT3Q12347 RNP1YLL046C 750 nt2.07□□□□□ -2.08
HRT3Q12347 RPL36AYMR194W 303 nt2.07□□□□□ -2.08
HRT3Q12347 SDC25YLL016W 3147 nt2.06□□□□□ -2.08
HRT3Q12347 TOR2YKL203C 7425 nt2.06□□□□□ -2.08
HRT3Q12347 YDL118WYDL118W 381 nt2.06□□□□□ -2.08
HRT3Q12347 ADK1YDR226W 669 nt2.06□□□□□ -2.08
HRT3Q12347 YGR050CYGR050C 357 nt2.06□□□□□ -2.08
HRT3Q12347 YOR146WYOR146W 306 nt2.06□□□□□ -2.08
HRT3Q12347 YPL225WYPL225W 441 nt2.06□□□□□ -2.08
HRT3Q12347 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt2.06□□□□□ -2.08
HRT3Q12347 YSY6YBR162W-A 198 nt2.06□□□□□ -2.08
HRT3Q12347 PUF4YGL014W 2667 nt2.06□□□□□ -2.08
HRT3Q12347 YJL016WYJL016W 1686 nt2.06□□□□□ -2.08
HRT3Q12347 RRP12YPL012W 3687 nt2.05□□□□□ -2.08
HRT3Q12347 NUP82YJL061W 2142 nt2.05□□□□□ -2.08
HRT3Q12347 YFH1YDL120W 525 nt2.05□□□□□ -2.08
HRT3Q12347 YER172C-AYER172C-A 381 nt2.05□□□□□ -2.08
HRT3Q12347 NCE101YJL205C 162 nt2.05□□□□□ -2.08
HRT3Q12347 YLR031WYLR031W 561 nt2.05□□□□□ -2.08
HRT3Q12347 YOR105WYOR105W 327 nt2.05□□□□□ -2.08
HRT3Q12347 TRM7YBR061C 933 nt2.05□□□□□ -2.08
HRT3Q12347 NOP14YDL148C 2433 nt2.05□□□□□ -2.08
HRT3Q12347 BRO1YPL084W 2535 nt2.05□□□□□ -2.08
HRT3Q12347 GIS1YDR096W 2685 nt2.04□□□□□ -2.08
HRT3Q12347 COX1Q0045 1605 nt2.04□□□□□ -2.08
HRT3Q12347 YDL068WYDL068W 330 nt2.04□□□□□ -2.08
HRT3Q12347 YER189WYER189W 369 nt2.04□□□□□ -2.08
HRT3Q12347 YKL136WYKL136W 399 nt2.04□□□□□ -2.08
HRT3Q12347 CGI121YML036W 546 nt2.04□□□□□ -2.08
HRT3Q12347 TRS130YMR218C 3309 nt2.04□□□□□ -2.08
HRT3Q12347 VPS52YDR484W 1926 nt2.03□□□□□ -2.08
HRT3Q12347 TIM9YEL020W-A 264 nt2.03□□□□□ -2.08
HRT3Q12347 URM1YIL008W 300 nt2.03□□□□□ -2.08
HRT3Q12347 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt2.03□□□□□ -2.08
HRT3Q12347 NEO1YIL048W 3456 nt2.03□□□□□ -2.08
HRT3Q12347 PSO2YMR137C 1986 nt2.03□□□□□ -2.08
HRT3Q12347 ECM25YJL201W 1800 nt2.03□□□□□ -2.09
HRT3Q12347 YNL018CYNL018C 1839 nt2.03□□□□□ -2.09
HRT3Q12347 NPR3YHL023C 3441 nt2.03□□□□□ -2.09
HRT3Q12347 EDS1YBR033W 2760 nt2.02□□□□□ -2.09
HRT3Q12347 YDL041WYDL041W 354 nt2.02□□□□□ -2.09
HRT3Q12347 SEC31YDL195W 3822 nt2.02□□□□□ -2.09
HRT3Q12347 YBL012CYBL012C 402 nt2.02□□□□□ -2.09
HRT3Q12347 YML099W-AYML099W-A 330 nt2.02□□□□□ -2.09
HRT3Q12347 YOR199WYOR199W 330 nt2.02□□□□□ -2.09
HRT3Q12347 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt2.02□□□□□ -2.09
HRT3Q12347 MGR1YCL044C 1254 nt2.02□□□□□ -2.09
HRT3Q12347 AFI1YOR129C 2682 nt2.01□□□□□ -2.09
HRT3Q12347 MRPL31YKL138C 396 nt2.01□□□□□ -2.09
HRT3Q12347 VTI1YMR197C 654 nt2.01□□□□□ -2.09
HRT3Q12347 USO1YDL058W 5373 nt2.01□□□□□ -2.09
HRT3Q12347 ASG1YIL130W 2895 nt2.01□□□□□ -2.09
HRT3Q12347 HOS4YIL112W 3252 nt2.01□□□□□ -2.09
HRT3Q12347 SIR4YDR227W 4077 nt2.01□□□□□ -2.09
HRT3Q12347 POM152YMR129W 4014 nt2.01□□□□□ -2.09
HRT3Q12347 KSP1YHR082C 3090 nt2.01□□□□□ -2.09
HRT3Q12347 MSS11YMR164C 2277 nt2.01□□□□□ -2.09
HRT3Q12347 RAM2YKL019W 951 nt2□□□□□ -2.09
HRT3Q12347 YMR320WYMR320W 306 nt2□□□□□ -2.09
HRT3Q12347 CRS5YOR031W 210 nt2□□□□□ -2.09
HRT3Q12347 YPL238CYPL238C 390 nt2□□□□□ -2.09
HRT3Q12347 IRC10YOL015W 1761 nt2□□□□□ -2.09
HRT3Q12347 YJR003CYJR003C 1560 nt1.99□□□□□ -2.09
HRT3Q12347 snR76snR76 109 nt1.99□□□□□ -2.09
HRT3Q12347 snR79snR79 84 nt1.99□□□□□ -2.09
HRT3Q12347 YER023C-AYER023C-A 213 nt1.99□□□□□ -2.09
HRT3Q12347 ABM1YJR108W 372 nt1.99□□□□□ -2.09
HRT3Q12347 YLR458WYLR458W 381 nt1.99□□□□□ -2.09
HRT3Q12347 RGM1YMR182C 636 nt1.99□□□□□ -2.09
HRT3Q12347 YBR197CYBR197C 654 nt1.99□□□□□ -2.09
HRT3Q12347 RAV1YJR033C 4074 nt1.99□□□□□ -2.09
HRT3Q12347 BAS1YKR099W 2436 nt1.99□□□□□ -2.09
HRT3Q12347 MGM1YOR211C 2646 nt1.99□□□□□ -2.09
HRT3Q12347 HSC82YMR186W 2118 nt1.99□□□□□ -2.09
HRT3Q12347 RPL40AYIL148W 387 nt1.98□□□□□ -2.09
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