Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt2.9□□□□□ -1.95
CLF1Q12309 PSY1YKL076C 384 nt2.9□□□□□ -1.95
CLF1Q12309 RPL9BYNL067W 576 nt2.9□□□□□ -1.95
CLF1Q12309 BAS1YKR099W 2436 nt2.9□□□□□ -1.95
CLF1Q12309 CDC24YAL041W 2565 nt2.9□□□□□ -1.95
CLF1Q12309 SMC6YLR383W 3345 nt2.9□□□□□ -1.95
CLF1Q12309 PEX4YGR133W 552 nt2.89□□□□□ -1.95
CLF1Q12309 RPL39YJL189W 156 nt2.89□□□□□ -1.95
CLF1Q12309 YOR050CYOR050C 348 nt2.89□□□□□ -1.95
CLF1Q12309 YPL229WYPL229W 621 nt2.89□□□□□ -1.95
CLF1Q12309 YIL166CYIL166C 1629 nt2.89□□□□□ -1.95
CLF1Q12309 SUL1YBR294W 2580 nt2.89□□□□□ -1.95
CLF1Q12309 PFF1YBR074W 2931 nt2.89□□□□□ -1.95
CLF1Q12309 RLI1YDR091C 1827 nt2.89□□□□□ -1.95
CLF1Q12309 YFL063WYFL063W 456 nt2.88□□□□□ -1.95
CLF1Q12309 CCW14YLR390W-A 717 nt2.87□□□□□ -1.95
CLF1Q12309 RGM1YMR182C 636 nt2.87□□□□□ -1.95
CLF1Q12309 HCH1YNL281W 462 nt2.87□□□□□ -1.95
CLF1Q12309 NOT5YPR072W 1683 nt2.87□□□□□ -1.95
CLF1Q12309 YDR186CYDR186C 2634 nt2.87□□□□□ -1.95
CLF1Q12309 UBP15YMR304W 3693 nt2.87□□□□□ -1.95
CLF1Q12309 NUP170YBL079W 4509 nt2.87□□□□□ -1.95
CLF1Q12309 PHO2YDL106C 1680 nt2.86□□□□□ -1.95
CLF1Q12309 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt2.86□□□□□ -1.95
CLF1Q12309 RPS29AYLR388W 171 nt2.86□□□□□ -1.95
CLF1Q12309 RPL25YOL127W 429 nt2.86□□□□□ -1.95
CLF1Q12309 CRS5YOR031W 210 nt2.86□□□□□ -1.95
CLF1Q12309 KRE33YNL132W 3171 nt2.86□□□□□ -1.95
CLF1Q12309 BRO1YPL084W 2535 nt2.85□□□□□ -1.95
CLF1Q12309 FAR11YNL127W 2862 nt2.85□□□□□ -1.95
CLF1Q12309 SSE1YPL106C 2082 nt2.85□□□□□ -1.95
CLF1Q12309 SIR3YLR442C 2937 nt2.85□□□□□ -1.95
CLF1Q12309 YDL011CYDL011C 324 nt2.85□□□□□ -1.95
CLF1Q12309 YMR324CYMR324C 243 nt2.85□□□□□ -1.95
CLF1Q12309 YOR225WYOR225W 330 nt2.85□□□□□ -1.95
CLF1Q12309 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt2.85□□□□□ -1.95
CLF1Q12309 PSD2YGR170W 3417 nt2.85□□□□□ -1.95
CLF1Q12309 snR79snR79 84 nt2.84□□□□□ -1.95
CLF1Q12309 DAD4YDR320C-A 219 nt2.84□□□□□ -1.95
CLF1Q12309 RPL40AYIL148W 387 nt2.84□□□□□ -1.95
CLF1Q12309 UTP30YKR060W 825 nt2.84□□□□□ -1.95
CLF1Q12309 TMA10YLR327C 261 nt2.84□□□□□ -1.95
CLF1Q12309 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.84□□□□□ -1.95
CLF1Q12309 SDC25YLL016W 3147 nt2.84□□□□□ -1.95
CLF1Q12309 ASG1YIL130W 2895 nt2.84□□□□□ -1.96
CLF1Q12309 IRC10YOL015W 1761 nt2.84□□□□□ -1.96
CLF1Q12309 CSN9YDR179C 489 nt2.83□□□□□ -1.96
CLF1Q12309 FCF2YLR051C 654 nt2.83□□□□□ -1.96
CLF1Q12309 JLP2YMR132C 627 nt2.83□□□□□ -1.96
CLF1Q12309 SWR1YDR334W 4545 nt2.82□□□□□ -1.96
CLF1Q12309 LEU3YLR451W 2661 nt2.82□□□□□ -1.96
CLF1Q12309 SPG3YDR504C 384 nt2.82□□□□□ -1.96
CLF1Q12309 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.82□□□□□ -1.96
CLF1Q12309 RPL36AYMR194W 303 nt2.82□□□□□ -1.96
CLF1Q12309 TRM7YBR061C 933 nt2.82□□□□□ -1.96
CLF1Q12309 YPR146CYPR146C 330 nt2.82□□□□□ -1.96
CLF1Q12309 YEF3YLR249W 3135 nt2.82□□□□□ -1.96
CLF1Q12309 NAN1YPL126W 2691 nt2.82□□□□□ -1.96
CLF1Q12309 RKM1YPL208W 1752 nt2.82□□□□□ -1.96
CLF1Q12309 PDR11YIL013C 4236 nt2.82□□□□□ -1.96
CLF1Q12309 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt2.81□□□□□ -1.96
CLF1Q12309 RPS24AYER074W 408 nt2.81□□□□□ -1.96
CLF1Q12309 YLR458WYLR458W 381 nt2.81□□□□□ -1.96
CLF1Q12309 VTC3YPL019C 2508 nt2.8□□□□□ -1.96
CLF1Q12309 Q0032Q0032 291 nt2.8□□□□□ -1.96
CLF1Q12309 snR80snR80 171 nt2.8□□□□□ -1.96
CLF1Q12309 RPL35AYDL191W 363 nt2.8□□□□□ -1.96
CLF1Q12309 RPS18BYML026C 441 nt2.8□□□□□ -1.96
CLF1Q12309 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt2.8□□□□□ -1.96
CLF1Q12309 AMS1YGL156W 3252 nt2.8□□□□□ -1.96
CLF1Q12309 TRS130YMR218C 3309 nt2.8□□□□□ -1.96
CLF1Q12309 YIL080WYIL080W 4722 nt2.79□□□□□ -1.96
CLF1Q12309 BNR1YIL159W 4128 nt2.79□□□□□ -1.96
CLF1Q12309 OSH6YKR003W 1347 nt2.79□□□□□ -1.96
CLF1Q12309 SRO77YBL106C 3033 nt2.79□□□□□ -1.96
CLF1Q12309 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt2.79□□□□□ -1.96
CLF1Q12309 YER121WYER121W 345 nt2.79□□□□□ -1.96
CLF1Q12309 YOP1YPR028W 543 nt2.79□□□□□ -1.96
CLF1Q12309 PSO2YMR137C 1986 nt2.79□□□□□ -1.96
CLF1Q12309 ECM25YJL201W 1800 nt2.79□□□□□ -1.96
CLF1Q12309 PRK1YIL095W 2433 nt2.79□□□□□ -1.96
CLF1Q12309 PHO91YNR013C 2685 nt2.78□□□□□ -1.96
CLF1Q12309 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt2.78□□□□□ -1.96
CLF1Q12309 SGO1YOR073W 1773 nt2.78□□□□□ -1.96
CLF1Q12309 OSW7YFR039C 1533 nt2.78□□□□□ -1.97
CLF1Q12309 KEL2YGR238C 2649 nt2.77□□□□□ -1.97
CLF1Q12309 SCP160YJL080C 3669 nt2.77□□□□□ -1.97
CLF1Q12309 SWA2YDR320C 2007 nt2.77□□□□□ -1.97
CLF1Q12309 CYC7YEL039C 342 nt2.77□□□□□ -1.97
CLF1Q12309 YJL015CYJL015C 285 nt2.77□□□□□ -1.97
CLF1Q12309 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt2.77□□□□□ -1.97
CLF1Q12309 MGR1YCL044C 1254 nt2.77□□□□□ -1.97
CLF1Q12309 MSS11YMR164C 2277 nt2.77□□□□□ -1.97
CLF1Q12309 YPR089WYPR089W 2667 nt2.76□□□□□ -1.97
CLF1Q12309 HRD3YLR207W 2502 nt2.76□□□□□ -1.97
CLF1Q12309 MZM1YDR493W 372 nt2.76□□□□□ -1.97
CLF1Q12309 YGR050CYGR050C 357 nt2.76□□□□□ -1.97
CLF1Q12309 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt2.76□□□□□ -1.97
CLF1Q12309 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt2.76□□□□□ -1.97
CLF1Q12309 RPL32YBL092W 393 nt2.76□□□□□ -1.97
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