Protein–RNA interactions for Protein: Q12229

UBX3, UBX domain-containing protein 3, yeastyeast

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Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX3Q12229 HYR1YIR037W 492 nt2.45□□□□□ -2.02
UBX3Q12229 TMA22YJR014W 597 nt2.45□□□□□ -2.02
UBX3Q12229 RPL36AYMR194W 303 nt2.45□□□□□ -2.02
UBX3Q12229 KRE33YNL132W 3171 nt2.45□□□□□ -2.02
UBX3Q12229 NUM1YDR150W 8247 nt2.45□□□□□ -2.02
UBX3Q12229 PSD2YGR170W 3417 nt2.45□□□□□ -2.02
UBX3Q12229 SAP1YER047C 2694 nt2.45□□□□□ -2.02
UBX3Q12229 HOS4YIL112W 3252 nt2.44□□□□□ -2.02
UBX3Q12229 PSY1YKL076C 384 nt2.44□□□□□ -2.02
UBX3Q12229 YNL018CYNL018C 1839 nt2.44□□□□□ -2.02
UBX3Q12229 YIL166CYIL166C 1629 nt2.43□□□□□ -2.02
UBX3Q12229 YIL080WYIL080W 4722 nt2.43□□□□□ -2.02
UBX3Q12229 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt2.43□□□□□ -2.02
UBX3Q12229 YFL063WYFL063W 456 nt2.43□□□□□ -2.02
UBX3Q12229 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.43□□□□□ -2.02
UBX3Q12229 FCF2YLR051C 654 nt2.43□□□□□ -2.02
UBX3Q12229 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt2.43□□□□□ -2.02
UBX3Q12229 NEW1YPL226W 3591 nt2.43□□□□□ -2.02
UBX3Q12229 HRD3YLR207W 2502 nt2.42□□□□□ -2.02
UBX3Q12229 EDS1YBR033W 2760 nt2.42□□□□□ -2.02
UBX3Q12229 STE11YLR362W 2154 nt2.42□□□□□ -2.02
UBX3Q12229 NOT5YPR072W 1683 nt2.42□□□□□ -2.02
UBX3Q12229 snR79snR79 84 nt2.42□□□□□ -2.02
UBX3Q12229 DAD4YDR320C-A 219 nt2.42□□□□□ -2.02
UBX3Q12229 HCH1YNL281W 462 nt2.42□□□□□ -2.02
UBX3Q12229 BRO1YPL084W 2535 nt2.42□□□□□ -2.02
UBX3Q12229 CDC24YAL041W 2565 nt2.42□□□□□ -2.02
UBX3Q12229 NFT1YKR103W 3657 nt2.41□□□□□ -2.02
UBX3Q12229 FLO11YIR019C 4104 nt2.41□□□□□ -2.02
UBX3Q12229 snR70snR70 164 nt2.41□□□□□ -2.02
UBX3Q12229 CCW14YLR390W-A 717 nt2.41□□□□□ -2.02
UBX3Q12229 RPL25YOL127W 429 nt2.41□□□□□ -2.02
UBX3Q12229 IRC10YOL015W 1761 nt2.41□□□□□ -2.02
UBX3Q12229 SSE1YPL106C 2082 nt2.4□□□□□ -2.02
UBX3Q12229 LEU3YLR451W 2661 nt2.4□□□□□ -2.02
UBX3Q12229 INP51YIL002C 2841 nt2.4□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 TRA1YHR099W 11235 nt2.4□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 SGM1YJR134C 2124 nt2.4□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 UTP30YKR060W 825 nt2.4□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 EMC6YLL014W 327 nt2.4□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 YMR324CYMR324C 243 nt2.4□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 YOR225WYOR225W 330 nt2.4□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.4□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 NAN1YPL126W 2691 nt2.4□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 ESC1YMR219W 4977 nt2.4□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 YDL011CYDL011C 324 nt2.39□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 SPG3YDR504C 384 nt2.39□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt2.39□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.39□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 TMA10YLR327C 261 nt2.39□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 JLP2YMR132C 627 nt2.39□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 DNA2YHR164C 4569 nt2.39□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 HSC82YMR186W 2118 nt2.39□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 RGA2YDR379W 3030 nt2.39□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 RKM1YPL208W 1752 nt2.38□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 Q0032Q0032 291 nt2.38□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt2.38□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 CSN9YDR179C 489 nt2.38□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 RPL40AYIL148W 387 nt2.38□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 SIR3YLR442C 2937 nt2.38□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 RPS18BYML026C 441 nt2.38□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 YPR146CYPR146C 330 nt2.38□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 PHO91YNR013C 2685 nt2.38□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 TRS130YMR218C 3309 nt2.38□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 ASG1YIL130W 2895 nt2.38□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 PRK1YIL095W 2433 nt2.37□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 snR80snR80 171 nt2.37□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 RPL35AYDL191W 363 nt2.37□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt2.37□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 RPS24AYER074W 408 nt2.37□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 LCL1YPL056C 306 nt2.37□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 TRM7YBR061C 933 nt2.37□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt2.37□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 snR43snR43 209 nt2.37□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 MSB1YOR188W 3414 nt2.37□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 PHO2YDL106C 1680 nt2.37□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 MSS11YMR164C 2277 nt2.37□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 PDR11YIL013C 4236 nt2.36□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 INP53YOR109W 3324 nt2.36□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 ECM25YJL201W 1800 nt2.36□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 SAK1YER129W 3429 nt2.36□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 HYP2YEL034W 474 nt2.36□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 CYC7YEL039C 342 nt2.36□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 LSO2YGR169C-A 279 nt2.36□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 YJL015CYJL015C 285 nt2.36□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt2.36□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 YLR458WYLR458W 381 nt2.36□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt2.36□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 YPR089WYPR089W 2667 nt2.36□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 YDR186CYDR186C 2634 nt2.36□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 SWR1YDR334W 4545 nt2.36□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 SVL3YPL032C 2478 nt2.35□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 NUP100YKL068W 2880 nt2.35□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 YOP1YPR028W 543 nt2.35□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 snR51snR51 107 nt2.35□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 MGR1YCL044C 1254 nt2.35□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 PSO2YMR137C 1986 nt2.35□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 OSW7YFR039C 1533 nt2.35□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 PRP6YBR055C 2700 nt2.35□□□□□ -2.03
UBX3Q12229 KSP1YHR082C 3090 nt2.34□□□□□ -2.03
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