Protein–RNA interactions for Protein: Q12069

PUS9, tRNA pseudouridine(32) synthase, mitochondrial, yeastyeast

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUS9Q12069 snR46snR46 197 nt2.94□□□□□ -1.94
PUS9Q12069 DRS2YAL026C 4068 nt2.94□□□□□ -1.94
PUS9Q12069 PDS5YMR076C 3834 nt2.94□□□□□ -1.94
PUS9Q12069 CIN8YEL061C 3003 nt2.93□□□□□ -1.94
PUS9Q12069 NPC2YDL046W 522 nt2.93□□□□□ -1.94
PUS9Q12069 YDR426CYDR426C 378 nt2.93□□□□□ -1.94
PUS9Q12069 YGL239CYGL239C 315 nt2.93□□□□□ -1.94
PUS9Q12069 RPS27BYHR021C 249 nt2.93□□□□□ -1.94
PUS9Q12069 PUF6YDR496C 1971 nt2.92□□□□□ -1.94
PUS9Q12069 EPL1YFL024C 2499 nt2.92□□□□□ -1.94
PUS9Q12069 CHS3YBR023C 3498 nt2.92□□□□□ -1.94
PUS9Q12069 YJL181WYJL181W 1836 nt2.92□□□□□ -1.94
PUS9Q12069 YNL034WYNL034W 1839 nt2.92□□□□□ -1.94
PUS9Q12069 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt2.92□□□□□ -1.94
PUS9Q12069 UPS1YLR193C 528 nt2.92□□□□□ -1.94
PUS9Q12069 YPR014CYPR014C 330 nt2.92□□□□□ -1.94
PUS9Q12069 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt2.92□□□□□ -1.94
PUS9Q12069 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt2.92□□□□□ -1.94
PUS9Q12069 TOF2YKR010C 2316 nt2.91□□□□□ -1.94
PUS9Q12069 YDR544CYDR544C 429 nt2.91□□□□□ -1.94
PUS9Q12069 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt2.91□□□□□ -1.94
PUS9Q12069 YIL058WYIL058W 285 nt2.91□□□□□ -1.94
PUS9Q12069 RSM19YNR037C 276 nt2.91□□□□□ -1.94
PUS9Q12069 MDM20YOL076W 2391 nt2.91□□□□□ -1.94
PUS9Q12069 TFB1YDR311W 1929 nt2.91□□□□□ -1.94
PUS9Q12069 EXO84YBR102C 2262 nt2.9□□□□□ -1.94
PUS9Q12069 SWA2YDR320C 2007 nt2.9□□□□□ -1.94
PUS9Q12069 CHS2YBR038W 2892 nt2.9□□□□□ -1.95
PUS9Q12069 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt2.9□□□□□ -1.95
PUS9Q12069 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.9□□□□□ -1.95
PUS9Q12069 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.9□□□□□ -1.95
PUS9Q12069 MRPL33YMR286W 261 nt2.9□□□□□ -1.95
PUS9Q12069 YOR376WYOR376W 369 nt2.9□□□□□ -1.95
PUS9Q12069 BUD4YJR092W 4344 nt2.89□□□□□ -1.95
PUS9Q12069 RIX1YHR197W 2292 nt2.89□□□□□ -1.95
PUS9Q12069 TFB5YDR079C-A 219 nt2.89□□□□□ -1.95
PUS9Q12069 RPS27AYKL156W 249 nt2.89□□□□□ -1.95
PUS9Q12069 APC9YLR102C 798 nt2.89□□□□□ -1.95
PUS9Q12069 YMR326CYMR326C 309 nt2.89□□□□□ -1.95
PUS9Q12069 PDE2YOR360C 1581 nt2.89□□□□□ -1.95
PUS9Q12069 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt2.89□□□□□ -1.95
PUS9Q12069 PRP42YDR235W 1635 nt2.89□□□□□ -1.95
PUS9Q12069 SPO14YKR031C 5052 nt2.89□□□□□ -1.95
PUS9Q12069 YCG1YDR325W 3108 nt2.88□□□□□ -1.95
PUS9Q12069 MET5YJR137C 4329 nt2.88□□□□□ -1.95
PUS9Q12069 RGC1YPR115W 3252 nt2.88□□□□□ -1.95
PUS9Q12069 ECM5YMR176W 4236 nt2.88□□□□□ -1.95
PUS9Q12069 KHA1YJL094C 2622 nt2.88□□□□□ -1.95
PUS9Q12069 FUN30YAL019W 3396 nt2.87□□□□□ -1.95
PUS9Q12069 HFM1YGL251C 3564 nt2.87□□□□□ -1.95
PUS9Q12069 SEC5YDR166C 2916 nt2.87□□□□□ -1.95
PUS9Q12069 APC2YLR127C 2562 nt2.87□□□□□ -1.95
PUS9Q12069 KEL2YGR238C 2649 nt2.87□□□□□ -1.95
PUS9Q12069 RBK1YCR036W 1002 nt2.87□□□□□ -1.95
PUS9Q12069 NUT2YPR168W 474 nt2.87□□□□□ -1.95
PUS9Q12069 RAX2YLR084C 3663 nt2.87□□□□□ -1.95
PUS9Q12069 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt2.87□□□□□ -1.95
PUS9Q12069 FRE2YKL220C 2136 nt2.87□□□□□ -1.95
PUS9Q12069 PEX8YGR077C 1770 nt2.87□□□□□ -1.95
PUS9Q12069 SOK1YDR006C 2706 nt2.86□□□□□ -1.95
PUS9Q12069 NMA111YNL123W 2994 nt2.86□□□□□ -1.95
PUS9Q12069 GYL1YMR192W 2163 nt2.86□□□□□ -1.95
PUS9Q12069 RSN1YMR266W 2862 nt2.86□□□□□ -1.95
PUS9Q12069 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.86□□□□□ -1.95
PUS9Q12069 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.86□□□□□ -1.95
PUS9Q12069 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.86□□□□□ -1.95
PUS9Q12069 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.86□□□□□ -1.95
PUS9Q12069 YER121WYER121W 345 nt2.86□□□□□ -1.95
PUS9Q12069 YPR092WYPR092W 306 nt2.86□□□□□ -1.95
PUS9Q12069 DIA2YOR080W 2199 nt2.85□□□□□ -1.95
PUS9Q12069 ITC1YGL133W 3795 nt2.85□□□□□ -1.95
PUS9Q12069 snR74snR74 88 nt2.85□□□□□ -1.95
PUS9Q12069 SSS1YDR086C 243 nt2.85□□□□□ -1.95
PUS9Q12069 INA22YIR024C 651 nt2.85□□□□□ -1.95
PUS9Q12069 YML037CYML037C 1023 nt2.85□□□□□ -1.95
PUS9Q12069 RIF1YBR275C 5751 nt2.85□□□□□ -1.95
PUS9Q12069 BRO1YPL084W 2535 nt2.85□□□□□ -1.95
PUS9Q12069 SNQ2YDR011W 4506 nt2.84□□□□□ -1.95
PUS9Q12069 LCD1YDR499W 2244 nt2.84□□□□□ -1.95
PUS9Q12069 CDC27YBL084C 2277 nt2.84□□□□□ -1.95
PUS9Q12069 LEU3YLR451W 2661 nt2.84□□□□□ -1.95
PUS9Q12069 YLR012CYLR012C 300 nt2.84□□□□□ -1.95
PUS9Q12069 YMR324CYMR324C 243 nt2.84□□□□□ -1.95
PUS9Q12069 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt2.84□□□□□ -1.95
PUS9Q12069 TIM12YBR091C 330 nt2.84□□□□□ -1.95
PUS9Q12069 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt2.84□□□□□ -1.96
PUS9Q12069 SRB8YCR081W 4284 nt2.84□□□□□ -1.96
PUS9Q12069 NCL1YBL024W 2055 nt2.83□□□□□ -1.96
PUS9Q12069 URB2YJR041C 3525 nt2.83□□□□□ -1.96
PUS9Q12069 YHL005CYHL005C 393 nt2.83□□□□□ -1.96
PUS9Q12069 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt2.83□□□□□ -1.96
PUS9Q12069 TAF2YCR042C 4224 nt2.83□□□□□ -1.96
PUS9Q12069 NFT1YKR103W 3657 nt2.83□□□□□ -1.96
PUS9Q12069 SKT5YBL061C 2091 nt2.83□□□□□ -1.96
PUS9Q12069 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt2.83□□□□□ -1.96
PUS9Q12069 NET1YJL076W 3570 nt2.82□□□□□ -1.96
PUS9Q12069 QCR7YDR529C 384 nt2.82□□□□□ -1.96
PUS9Q12069 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.82□□□□□ -1.96
PUS9Q12069 YHR210CYHR210C 1026 nt2.82□□□□□ -1.96
PUS9Q12069 YHR217CYHR217C 462 nt2.82□□□□□ -1.96
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