Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms