Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms