Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms