Protein–RNA interactions for Protein: Q07458

RXT3, Transcriptional regulatory protein RXT3, yeastyeast

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RXT3Q07458 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt2.83□□□□□ -1.96
RXT3Q07458 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt2.83□□□□□ -1.96
RXT3Q07458 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt2.83□□□□□ -1.96
RXT3Q07458 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt2.83□□□□□ -1.96
RXT3Q07458 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt2.83□□□□□ -1.96
RXT3Q07458 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt2.83□□□□□ -1.96
RXT3Q07458 YCL019WYCL019W 5313 nt2.83□□□□□ -1.96
RXT3Q07458 ITC1YGL133W 3795 nt2.83□□□□□ -1.96
RXT3Q07458 CUL3YGR003W 2235 nt2.83□□□□□ -1.96
RXT3Q07458 MPH1YIR002C 2982 nt2.82□□□□□ -1.96
RXT3Q07458 APC9YLR102C 798 nt2.82□□□□□ -1.96
RXT3Q07458 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt2.82□□□□□ -1.96
RXT3Q07458 YPR092WYPR092W 306 nt2.82□□□□□ -1.96
RXT3Q07458 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt2.82□□□□□ -1.96
RXT3Q07458 TRS120YDR407C 3870 nt2.82□□□□□ -1.96
RXT3Q07458 RIX1YHR197W 2292 nt2.82□□□□□ -1.96
RXT3Q07458 NTO1YPR031W 2247 nt2.81□□□□□ -1.96
RXT3Q07458 RIF1YBR275C 5751 nt2.81□□□□□ -1.96
RXT3Q07458 VPS54YDR027C 2670 nt2.81□□□□□ -1.96
RXT3Q07458 SEC5YDR166C 2916 nt2.81□□□□□ -1.96
RXT3Q07458 YDR286CYDR286C 345 nt2.81□□□□□ -1.96
RXT3Q07458 GRX8YLR364W 330 nt2.81□□□□□ -1.96
RXT3Q07458 YOR333CYOR333C 417 nt2.81□□□□□ -1.96
RXT3Q07458 MDN1YLR106C 14733 nt2.81□□□□□ -1.96
RXT3Q07458 SLA1YBL007C 3735 nt2.8□□□□□ -1.96
RXT3Q07458 YAT2YER024W 2772 nt2.8□□□□□ -1.96
RXT3Q07458 PUF4YGL014W 2667 nt2.8□□□□□ -1.96
RXT3Q07458 URA2YJL130C 6645 nt2.8□□□□□ -1.96
RXT3Q07458 TMN3YER113C 2121 nt2.8□□□□□ -1.96
RXT3Q07458 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt2.8□□□□□ -1.96
RXT3Q07458 TMA19YKL056C 504 nt2.8□□□□□ -1.96
RXT3Q07458 RPS8AYBL072C 603 nt2.8□□□□□ -1.96
RXT3Q07458 SNC2YOR327C 348 nt2.8□□□□□ -1.96
RXT3Q07458 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt2.8□□□□□ -1.96
RXT3Q07458 snR52snR52 92 nt2.8□□□□□ -1.96
RXT3Q07458 COP1YDL145C 3606 nt2.8□□□□□ -1.96
RXT3Q07458 ALK2YBL009W 2031 nt2.8□□□□□ -1.96
RXT3Q07458 RPS27BYHR021C 249 nt2.79□□□□□ -1.96
RXT3Q07458 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt2.79□□□□□ -1.96
RXT3Q07458 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt2.79□□□□□ -1.96
RXT3Q07458 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt2.79□□□□□ -1.96
RXT3Q07458 MET5YJR137C 4329 nt2.79□□□□□ -1.96
RXT3Q07458 GIS4YML006C 2325 nt2.79□□□□□ -1.96
RXT3Q07458 SGD1YLR336C 2700 nt2.78□□□□□ -1.96
RXT3Q07458 DSE4YNR067C 3354 nt2.78□□□□□ -1.96
RXT3Q07458 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt2.78□□□□□ -1.96
RXT3Q07458 YML037CYML037C 1023 nt2.78□□□□□ -1.96
RXT3Q07458 NAB3YPL190C 2409 nt2.78□□□□□ -1.97
RXT3Q07458 YOL057WYOL057W 2136 nt2.77□□□□□ -1.97
RXT3Q07458 SWA2YDR320C 2007 nt2.77□□□□□ -1.97
RXT3Q07458 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt2.77□□□□□ -1.97
RXT3Q07458 RRP5YMR229C 5190 nt2.77□□□□□ -1.97
RXT3Q07458 PLC1YPL268W 2610 nt2.77□□□□□ -1.97
RXT3Q07458 ORC2YBR060C 1863 nt2.77□□□□□ -1.97
RXT3Q07458 MUK1YPL070W 1839 nt2.77□□□□□ -1.97
RXT3Q07458 POM152YMR129W 4014 nt2.77□□□□□ -1.97
RXT3Q07458 NOP53YPL146C 1368 nt2.76□□□□□ -1.97
RXT3Q07458 VPS35YJL154C 2835 nt2.76□□□□□ -1.97
RXT3Q07458 PEX8YGR077C 1770 nt2.76□□□□□ -1.97
RXT3Q07458 SPT21YMR179W 2277 nt2.76□□□□□ -1.97
RXT3Q07458 VPS53YJL029C 2469 nt2.76□□□□□ -1.97
RXT3Q07458 CFT2YLR115W 2580 nt2.75□□□□□ -1.97
RXT3Q07458 FAP7YDL166C 594 nt2.75□□□□□ -1.97
RXT3Q07458 YFL065CYFL065C 309 nt2.75□□□□□ -1.97
RXT3Q07458 RPL20AYMR242C 519 nt2.75□□□□□ -1.97
RXT3Q07458 YBL109WYBL109W 336 nt2.75□□□□□ -1.97
RXT3Q07458 PSK2YOL045W 3306 nt2.75□□□□□ -1.97
RXT3Q07458 SOK1YDR006C 2706 nt2.75□□□□□ -1.97
RXT3Q07458 YBL053WYBL053W 375 nt2.74□□□□□ -1.97
RXT3Q07458 SGF11YPL047W 300 nt2.74□□□□□ -1.97
RXT3Q07458 TRM2YKR056W 1920 nt2.74□□□□□ -1.97
RXT3Q07458 TSC11YER093C 4293 nt2.73□□□□□ -1.97
RXT3Q07458 CHO2YGR157W 2610 nt2.73□□□□□ -1.97
RXT3Q07458 SSM4YIL030C 3960 nt2.73□□□□□ -1.97
RXT3Q07458 YPR022CYPR022C 3402 nt2.73□□□□□ -1.97
RXT3Q07458 SSQ1YLR369W 1974 nt2.73□□□□□ -1.97
RXT3Q07458 RPL34BYIL052C 366 nt2.73□□□□□ -1.97
RXT3Q07458 RGM1YMR182C 636 nt2.73□□□□□ -1.97
RXT3Q07458 PKH1YDR490C 2301 nt2.73□□□□□ -1.97
RXT3Q07458 AUS1YOR011W 4185 nt2.72□□□□□ -1.97
RXT3Q07458 MPT5YGL178W 2580 nt2.72□□□□□ -1.97
RXT3Q07458 ORC1YML065W 2745 nt2.72□□□□□ -1.97
RXT3Q07458 SUP56tL(CAA)A 82 nt2.72□□□□□ -1.97
RXT3Q07458 SUP53tL(CAA)C 82 nt2.72□□□□□ -1.97
RXT3Q07458 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt2.72□□□□□ -1.97
RXT3Q07458 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt2.72□□□□□ -1.97
RXT3Q07458 SUP54tL(CAA)G2 82 nt2.72□□□□□ -1.97
RXT3Q07458 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt2.72□□□□□ -1.97
RXT3Q07458 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt2.72□□□□□ -1.97
RXT3Q07458 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt2.72□□□□□ -1.97
RXT3Q07458 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt2.72□□□□□ -1.97
RXT3Q07458 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt2.72□□□□□ -1.97
RXT3Q07458 MTR4YJL050W 3222 nt2.72□□□□□ -1.97
RXT3Q07458 ATG26YLR189C 3597 nt2.72□□□□□ -1.97
RXT3Q07458 RAD2YGR258C 3096 nt2.71□□□□□ -1.98
RXT3Q07458 PSF1YDR013W 627 nt2.71□□□□□ -1.98
RXT3Q07458 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt2.71□□□□□ -1.98
RXT3Q07458 VMA9YCL005W-A 222 nt2.71□□□□□ -1.98
RXT3Q07458 YEL043WYEL043W 2871 nt2.71□□□□□ -1.98
RXT3Q07458 PSY2YNL201C 2577 nt2.71□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 62.9 ms