Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms