Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOX4Q06945 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms