Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms