Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms