Protein–RNA interactions for Protein: Q03591

CFHR1, Complement factor H-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR1Q03591 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CFHR1Q03591 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms