Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms