Protein–RNA interactions for Protein: Q02979

GDE1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GDE1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GDE1Q02979 RTC6YPL183W-A 282 nt3.15□□□□□ -1.91
GDE1Q02979 YLR278CYLR278C 4026 nt3.15□□□□□ -1.91
GDE1Q02979 CAF120YNL278W 3183 nt3.15□□□□□ -1.91
GDE1Q02979 SLN1YIL147C 3663 nt3.15□□□□□ -1.91
GDE1Q02979 ATG13YPR185W 2217 nt3.14□□□□□ -1.91
GDE1Q02979 RPL35AYDL191W 363 nt3.14□□□□□ -1.91
GDE1Q02979 YGL149WYGL149W 306 nt3.14□□□□□ -1.91
GDE1Q02979 RPS27AYKL156W 249 nt3.14□□□□□ -1.91
GDE1Q02979 YML037CYML037C 1023 nt3.14□□□□□ -1.91
GDE1Q02979 RPL32YBL092W 393 nt3.14□□□□□ -1.91
GDE1Q02979 NFT1YKR103W 3657 nt3.14□□□□□ -1.91
GDE1Q02979 RSE1YML049C 4086 nt3.14□□□□□ -1.91
GDE1Q02979 HCH1YNL281W 462 nt3.13□□□□□ -1.91
GDE1Q02979 VPS35YJL154C 2835 nt3.12□□□□□ -1.91
GDE1Q02979 FMP16YDR070C 282 nt3.12□□□□□ -1.91
GDE1Q02979 DNA2YHR164C 4569 nt3.11□□□□□ -1.91
GDE1Q02979 HTL1YCR020W-B 237 nt3.11□□□□□ -1.91
GDE1Q02979 RPL36AYMR194W 303 nt3.11□□□□□ -1.91
GDE1Q02979 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt3.11□□□□□ -1.91
GDE1Q02979 YPR099CYPR099C 357 nt3.11□□□□□ -1.91
GDE1Q02979 snR51snR51 107 nt3.11□□□□□ -1.91
GDE1Q02979 OSH6YKR003W 1347 nt3.11□□□□□ -1.91
GDE1Q02979 FLO11YIR019C 4104 nt3.11□□□□□ -1.91
GDE1Q02979 TFC4YGR047C 3078 nt3.11□□□□□ -1.91
GDE1Q02979 DOT6YER088C 2013 nt3.1□□□□□ -1.91
GDE1Q02979 CSN9YDR179C 489 nt3.1□□□□□ -1.91
GDE1Q02979 YOP1YPR028W 543 nt3.1□□□□□ -1.91
GDE1Q02979 PAC1YOR269W 1485 nt3.09□□□□□ -1.91
GDE1Q02979 SPG3YDR504C 384 nt3.09□□□□□ -1.91
GDE1Q02979 YJL015CYJL015C 285 nt3.09□□□□□ -1.91
GDE1Q02979 SNC2YOR327C 348 nt3.09□□□□□ -1.91
GDE1Q02979 NAB6YML117W 3405 nt3.09□□□□□ -1.91
GDE1Q02979 SNU114YKL173W 3027 nt3.09□□□□□ -1.91
GDE1Q02979 SMD1YGR074W 441 nt3.08□□□□□ -1.92
GDE1Q02979 YIL059CYIL059C 366 nt3.08□□□□□ -1.92
GDE1Q02979 HTB2YBL002W 396 nt3.08□□□□□ -1.92
GDE1Q02979 SOK2YMR016C 2358 nt3.08□□□□□ -1.92
GDE1Q02979 YPL150WYPL150W 2706 nt3.07□□□□□ -1.92
GDE1Q02979 KAP123YER110C 3342 nt3.07□□□□□ -1.92
GDE1Q02979 VPS16YPL045W 2397 nt3.07□□□□□ -1.92
GDE1Q02979 RBK1YCR036W 1002 nt3.07□□□□□ -1.92
GDE1Q02979 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt3.07□□□□□ -1.92
GDE1Q02979 YBT1YLL048C 4986 nt3.07□□□□□ -1.92
GDE1Q02979 BCK1YJL095W 4437 nt3.07□□□□□ -1.92
GDE1Q02979 TOF2YKR010C 2316 nt3.07□□□□□ -1.92
GDE1Q02979 YGR067CYGR067C 2415 nt3.07□□□□□ -1.92
GDE1Q02979 INP53YOR109W 3324 nt3.06□□□□□ -1.92
GDE1Q02979 YDR209CYDR209C 414 nt3.06□□□□□ -1.92
GDE1Q02979 DFG16YOR030W 1860 nt3.06□□□□□ -1.92
GDE1Q02979 VMA9YCL005W-A 222 nt3.06□□□□□ -1.92
GDE1Q02979 BUB1YGR188C 3066 nt3.06□□□□□ -1.92
GDE1Q02979 GEA1YJR031C 4227 nt3.05□□□□□ -1.92
GDE1Q02979 YDR344CYDR344C 444 nt3.05□□□□□ -1.92
GDE1Q02979 PAN3YKL025C 2040 nt3.04□□□□□ -1.92
GDE1Q02979 YDR186CYDR186C 2634 nt3.04□□□□□ -1.92
GDE1Q02979 ACB1YGR037C 264 nt3.04□□□□□ -1.92
GDE1Q02979 YGR265WYGR265W 411 nt3.04□□□□□ -1.92
GDE1Q02979 MRPL33YMR286W 261 nt3.04□□□□□ -1.92
GDE1Q02979 RPL36BYPL249C-A 303 nt3.04□□□□□ -1.92
GDE1Q02979 BFA1YJR053W 1725 nt3.04□□□□□ -1.92
GDE1Q02979 PRP8YHR165C 7242 nt3.04□□□□□ -1.92
GDE1Q02979 RIM20YOR275C 1986 nt3.03□□□□□ -1.92
GDE1Q02979 YGL069CYGL069C 465 nt3.03□□□□□ -1.92
GDE1Q02979 NOP10YHR072W-A 177 nt3.03□□□□□ -1.92
GDE1Q02979 YIL174WYIL174W 228 nt3.03□□□□□ -1.92
GDE1Q02979 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt3.03□□□□□ -1.92
GDE1Q02979 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt3.03□□□□□ -1.92
GDE1Q02979 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt3.03□□□□□ -1.92
GDE1Q02979 YDR239CYDR239C 2364 nt3.03□□□□□ -1.92
GDE1Q02979 ISW1YBR245C 3390 nt3.03□□□□□ -1.93
GDE1Q02979 ECM29YHL030W 5607 nt3.02□□□□□ -1.93
GDE1Q02979 ALK2YBL009W 2031 nt3.02□□□□□ -1.93
GDE1Q02979 AXL1YPR122W 3627 nt3.02□□□□□ -1.93
GDE1Q02979 TOP2YNL088W 4287 nt3.02□□□□□ -1.93
GDE1Q02979 TUS1YLR425W 3924 nt3.02□□□□□ -1.93
GDE1Q02979 PHS1YJL097W 654 nt3.02□□□□□ -1.93
GDE1Q02979 SUL1YBR294W 2580 nt3.01□□□□□ -1.93
GDE1Q02979 CYC7YEL039C 342 nt3.01□□□□□ -1.93
GDE1Q02979 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt3.01□□□□□ -1.93
GDE1Q02979 RPS22AYJL190C 393 nt3.01□□□□□ -1.93
GDE1Q02979 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt3.01□□□□□ -1.93
GDE1Q02979 RPL38YLR325C 237 nt3.01□□□□□ -1.93
GDE1Q02979 RIC1YLR039C 3171 nt3.01□□□□□ -1.93
GDE1Q02979 INP51YIL002C 2841 nt3.01□□□□□ -1.93
GDE1Q02979 CYR1YJL005W 6081 nt3.01□□□□□ -1.93
GDE1Q02979 SEC26YDR238C 2922 nt3□□□□□ -1.93
GDE1Q02979 TAE2YPL009C 3117 nt3□□□□□ -1.93
GDE1Q02979 RPO41YFL036W 4056 nt2.99□□□□□ -1.93
GDE1Q02979 YEL043WYEL043W 2871 nt2.99□□□□□ -1.93
GDE1Q02979 YDR048CYDR048C 315 nt2.99□□□□□ -1.93
GDE1Q02979 YIL102CYIL102C 306 nt2.99□□□□□ -1.93
GDE1Q02979 YLR053CYLR053C 327 nt2.99□□□□□ -1.93
GDE1Q02979 HHT1YBR010W 411 nt2.99□□□□□ -1.93
GDE1Q02979 ACM1YPL267W 630 nt2.99□□□□□ -1.93
GDE1Q02979 YBR277CYBR277C 402 nt2.99□□□□□ -1.93
GDE1Q02979 ESL2YKR096W 3588 nt2.99□□□□□ -1.93
GDE1Q02979 TMN3YER113C 2121 nt2.99□□□□□ -1.93
GDE1Q02979 YKU80YMR106C 1890 nt2.99□□□□□ -1.93
GDE1Q02979 RIF1YBR275C 5751 nt2.98□□□□□ -1.93
GDE1Q02979 SAP1YER047C 2694 nt2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 167.7 ms