Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms