Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms