Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms