Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms