Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAP1Q01518 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAP1Q01518 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAP1Q01518 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAP1Q01518 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CAP1Q01518 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAP1Q01518 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAP1Q01518 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAP1Q01518 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAP1Q01518 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAP1Q01518 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAP1Q01518 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAP1Q01518 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAP1Q01518 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAP1Q01518 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAP1Q01518 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAP1Q01518 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAP1Q01518 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAP1Q01518 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAP1Q01518 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAP1Q01518 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAP1Q01518 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAP1Q01518 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAP1Q01518 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAP1Q01518 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAP1Q01518 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAP1Q01518 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAP1Q01518 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAP1Q01518 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAP1Q01518 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms