Protein–RNA interactions for Protein: Q00653

NFKB2, Nuclear factor NF-kappa-B p100 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB2Q00653 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NFKB2Q00653 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NFKB2Q00653 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NFKB2Q00653 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NFKB2Q00653 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NFKB2Q00653 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFKB2Q00653 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NFKB2Q00653 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFKB2Q00653 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFKB2Q00653 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFKB2Q00653 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFKB2Q00653 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFKB2Q00653 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFKB2Q00653 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFKB2Q00653 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFKB2Q00653 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFKB2Q00653 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFKB2Q00653 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFKB2Q00653 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFKB2Q00653 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NFKB2Q00653 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFKB2Q00653 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFKB2Q00653 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFKB2Q00653 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFKB2Q00653 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFKB2Q00653 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFKB2Q00653 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFKB2Q00653 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFKB2Q00653 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFKB2Q00653 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFKB2Q00653 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NFKB2Q00653 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NFKB2Q00653 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFKB2Q00653 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFKB2Q00653 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFKB2Q00653 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFKB2Q00653 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFKB2Q00653 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFKB2Q00653 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFKB2Q00653 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms