Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms