Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPM4P67936 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPM4P67936 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPM4P67936 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPM4P67936 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TPM4P67936 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPM4P67936 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPM4P67936 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPM4P67936 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPM4P67936 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPM4P67936 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPM4P67936 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPM4P67936 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPM4P67936 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPM4P67936 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPM4P67936 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPM4P67936 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TPM4P67936 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPM4P67936 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPM4P67936 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPM4P67936 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPM4P67936 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPM4P67936 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPM4P67936 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPM4P67936 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPM4P67936 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPM4P67936 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPM4P67936 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPM4P67936 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPM4P67936 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPM4P67936 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPM4P67936 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPM4P67936 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPM4P67936 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPM4P67936 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPM4P67936 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPM4P67936 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPM4P67936 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPM4P67936 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPM4P67936 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPM4P67936 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPM4P67936 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPM4P67936 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPM4P67936 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPM4P67936 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPM4P67936 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPM4P67936 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPM4P67936 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPM4P67936 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPM4P67936 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPM4P67936 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPM4P67936 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPM4P67936 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TPM4P67936 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TPM4P67936 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TPM4P67936 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPM4P67936 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPM4P67936 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPM4P67936 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPM4P67936 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPM4P67936 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPM4P67936 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPM4P67936 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPM4P67936 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPM4P67936 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPM4P67936 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPM4P67936 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPM4P67936 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPM4P67936 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPM4P67936 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPM4P67936 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPM4P67936 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPM4P67936 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPM4P67936 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPM4P67936 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPM4P67936 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPM4P67936 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPM4P67936 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPM4P67936 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPM4P67936 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPM4P67936 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPM4P67936 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPM4P67936 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPM4P67936 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPM4P67936 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPM4P67936 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPM4P67936 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPM4P67936 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPM4P67936 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TPM4P67936 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TPM4P67936 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TPM4P67936 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TPM4P67936 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TPM4P67936 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TPM4P67936 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TPM4P67936 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TPM4P67936 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPM4P67936 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPM4P67936 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TPM4P67936 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms