Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKP1P63208 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKP1P63208 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKP1P63208 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SKP1P63208 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SKP1P63208 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKP1P63208 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKP1P63208 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SKP1P63208 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKP1P63208 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKP1P63208 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKP1P63208 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKP1P63208 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKP1P63208 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKP1P63208 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKP1P63208 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKP1P63208 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKP1P63208 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKP1P63208 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKP1P63208 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKP1P63208 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKP1P63208 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKP1P63208 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKP1P63208 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKP1P63208 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKP1P63208 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SKP1P63208 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKP1P63208 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKP1P63208 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKP1P63208 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKP1P63208 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKP1P63208 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKP1P63208 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKP1P63208 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKP1P63208 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKP1P63208 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SKP1P63208 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKP1P63208 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKP1P63208 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKP1P63208 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKP1P63208 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKP1P63208 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKP1P63208 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKP1P63208 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKP1P63208 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKP1P63208 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKP1P63208 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKP1P63208 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKP1P63208 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SKP1P63208 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKP1P63208 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKP1P63208 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKP1P63208 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKP1P63208 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKP1P63208 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKP1P63208 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKP1P63208 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKP1P63208 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKP1P63208 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKP1P63208 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SKP1P63208 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SKP1P63208 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SKP1P63208 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SKP1P63208 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SKP1P63208 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SKP1P63208 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SKP1P63208 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SKP1P63208 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SKP1P63208 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKP1P63208 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKP1P63208 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKP1P63208 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKP1P63208 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKP1P63208 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKP1P63208 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKP1P63208 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKP1P63208 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKP1P63208 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKP1P63208 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKP1P63208 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKP1P63208 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKP1P63208 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKP1P63208 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKP1P63208 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKP1P63208 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKP1P63208 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKP1P63208 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKP1P63208 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKP1P63208 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKP1P63208 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKP1P63208 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKP1P63208 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SKP1P63208 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKP1P63208 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKP1P63208 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKP1P63208 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKP1P63208 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKP1P63208 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKP1P63208 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SKP1P63208 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms