Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms