Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2NP61088 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2NP61088 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2NP61088 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2NP61088 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2NP61088 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2NP61088 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2NP61088 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2NP61088 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2NP61088 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2NP61088 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2NP61088 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2NP61088 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2NP61088 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2NP61088 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2NP61088 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2NP61088 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2NP61088 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2NP61088 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2NP61088 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2NP61088 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2NP61088 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2NP61088 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2NP61088 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2NP61088 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2NP61088 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2NP61088 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2NP61088 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2NP61088 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2NP61088 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2NP61088 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2NP61088 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2NP61088 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2NP61088 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2NP61088 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2NP61088 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2NP61088 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2NP61088 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2NP61088 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2NP61088 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBE2NP61088 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBE2NP61088 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBE2NP61088 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBE2NP61088 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBE2NP61088 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBE2NP61088 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBE2NP61088 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBE2NP61088 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2NP61088 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2NP61088 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2NP61088 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2NP61088 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2NP61088 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2NP61088 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2NP61088 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2NP61088 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2NP61088 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2NP61088 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2NP61088 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2NP61088 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2NP61088 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2NP61088 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2NP61088 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2NP61088 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2NP61088 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2NP61088 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2NP61088 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2NP61088 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2NP61088 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2NP61088 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2NP61088 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2NP61088 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2NP61088 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2NP61088 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2NP61088 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2NP61088 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2NP61088 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2NP61088 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2NP61088 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2NP61088 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2NP61088 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2NP61088 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2NP61088 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2NP61088 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2NP61088 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2NP61088 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2NP61088 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2NP61088 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2NP61088 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2NP61088 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2NP61088 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2NP61088 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2NP61088 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2NP61088 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2NP61088 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2NP61088 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2NP61088 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2NP61088 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2NP61088 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2NP61088 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms