Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms