Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
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