Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms