Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BACE1P56817 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BACE1P56817 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BACE1P56817 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BACE1P56817 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BACE1P56817 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BACE1P56817 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BACE1P56817 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BACE1P56817 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BACE1P56817 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BACE1P56817 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BACE1P56817 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BACE1P56817 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BACE1P56817 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BACE1P56817 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BACE1P56817 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BACE1P56817 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BACE1P56817 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
BACE1P56817 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BACE1P56817 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BACE1P56817 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BACE1P56817 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BACE1P56817 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BACE1P56817 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BACE1P56817 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BACE1P56817 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BACE1P56817 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BACE1P56817 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BACE1P56817 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
BACE1P56817 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BACE1P56817 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BACE1P56817 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BACE1P56817 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BACE1P56817 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BACE1P56817 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BACE1P56817 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BACE1P56817 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BACE1P56817 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BACE1P56817 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BACE1P56817 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BACE1P56817 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BACE1P56817 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BACE1P56817 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BACE1P56817 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BACE1P56817 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
BACE1P56817 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BACE1P56817 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BACE1P56817 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BACE1P56817 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BACE1P56817 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BACE1P56817 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BACE1P56817 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BACE1P56817 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BACE1P56817 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BACE1P56817 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BACE1P56817 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BACE1P56817 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BACE1P56817 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BACE1P56817 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BACE1P56817 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
BACE1P56817 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BACE1P56817 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BACE1P56817 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BACE1P56817 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BACE1P56817 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
BACE1P56817 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BACE1P56817 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BACE1P56817 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BACE1P56817 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BACE1P56817 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BACE1P56817 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BACE1P56817 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BACE1P56817 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BACE1P56817 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BACE1P56817 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BACE1P56817 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BACE1P56817 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BACE1P56817 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BACE1P56817 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BACE1P56817 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BACE1P56817 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BACE1P56817 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BACE1P56817 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BACE1P56817 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BACE1P56817 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BACE1P56817 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BACE1P56817 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BACE1P56817 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BACE1P56817 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BACE1P56817 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BACE1P56817 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BACE1P56817 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BACE1P56817 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BACE1P56817 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BACE1P56817 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BACE1P56817 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BACE1P56817 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BACE1P56817 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BACE1P56817 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BACE1P56817 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms