Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX10P56693 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX10P56693 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX10P56693 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX10P56693 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX10P56693 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX10P56693 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX10P56693 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX10P56693 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX10P56693 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX10P56693 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX10P56693 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX10P56693 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX10P56693 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX10P56693 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX10P56693 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX10P56693 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX10P56693 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX10P56693 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX10P56693 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX10P56693 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX10P56693 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX10P56693 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX10P56693 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX10P56693 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX10P56693 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX10P56693 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX10P56693 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX10P56693 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX10P56693 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX10P56693 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX10P56693 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX10P56693 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX10P56693 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX10P56693 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX10P56693 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX10P56693 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX10P56693 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX10P56693 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX10P56693 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX10P56693 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX10P56693 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX10P56693 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX10P56693 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX10P56693 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX10P56693 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX10P56693 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX10P56693 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX10P56693 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX10P56693 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX10P56693 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX10P56693 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX10P56693 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX10P56693 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX10P56693 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX10P56693 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX10P56693 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX10P56693 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX10P56693 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX10P56693 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX10P56693 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX10P56693 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX10P56693 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX10P56693 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX10P56693 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX10P56693 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX10P56693 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX10P56693 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX10P56693 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX10P56693 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX10P56693 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX10P56693 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX10P56693 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX10P56693 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX10P56693 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX10P56693 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX10P56693 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX10P56693 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX10P56693 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX10P56693 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX10P56693 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX10P56693 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX10P56693 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX10P56693 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX10P56693 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX10P56693 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX10P56693 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX10P56693 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX10P56693 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SOX10P56693 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SOX10P56693 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SOX10P56693 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SOX10P56693 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SOX10P56693 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SOX10P56693 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOX10P56693 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOX10P56693 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SOX10P56693 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOX10P56693 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOX10P56693 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms