Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP9P55211 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP9P55211 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP9P55211 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP9P55211 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP9P55211 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP9P55211 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP9P55211 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP9P55211 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP9P55211 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP9P55211 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP9P55211 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP9P55211 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP9P55211 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP9P55211 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP9P55211 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP9P55211 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP9P55211 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP9P55211 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP9P55211 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CASP9P55211 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CASP9P55211 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CASP9P55211 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP9P55211 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP9P55211 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP9P55211 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP9P55211 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP9P55211 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP9P55211 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP9P55211 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP9P55211 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP9P55211 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP9P55211 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP9P55211 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP9P55211 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP9P55211 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP9P55211 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP9P55211 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP9P55211 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP9P55211 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP9P55211 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP9P55211 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP9P55211 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP9P55211 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP9P55211 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP9P55211 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP9P55211 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP9P55211 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP9P55211 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP9P55211 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP9P55211 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP9P55211 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP9P55211 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP9P55211 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP9P55211 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP9P55211 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP9P55211 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP9P55211 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP9P55211 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP9P55211 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP9P55211 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP9P55211 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP9P55211 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP9P55211 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP9P55211 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP9P55211 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP9P55211 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP9P55211 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP9P55211 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP9P55211 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP9P55211 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP9P55211 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP9P55211 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP9P55211 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP9P55211 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP9P55211 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP9P55211 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP9P55211 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP9P55211 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP9P55211 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP9P55211 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP9P55211 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP9P55211 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP9P55211 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP9P55211 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP9P55211 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP9P55211 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP9P55211 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP9P55211 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP9P55211 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP9P55211 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP9P55211 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP9P55211 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP9P55211 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP9P55211 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP9P55211 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP9P55211 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP9P55211 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP9P55211 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP9P55211 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms