Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms