Protein–RNA interactions for Protein: P51790

CLCN3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3P51790 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLCN3P51790 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms