Protein–RNA interactions for Protein: P51784

USP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11P51784 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP11P51784 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP11P51784 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP11P51784 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP11P51784 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP11P51784 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP11P51784 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP11P51784 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP11P51784 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
USP11P51784 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP11P51784 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
USP11P51784 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP11P51784 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP11P51784 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP11P51784 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP11P51784 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP11P51784 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP11P51784 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP11P51784 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP11P51784 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP11P51784 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP11P51784 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP11P51784 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP11P51784 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP11P51784 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP11P51784 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP11P51784 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP11P51784 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP11P51784 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP11P51784 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP11P51784 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP11P51784 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP11P51784 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP11P51784 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP11P51784 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP11P51784 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP11P51784 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
USP11P51784 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP11P51784 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP11P51784 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP11P51784 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP11P51784 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP11P51784 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP11P51784 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP11P51784 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP11P51784 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP11P51784 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP11P51784 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP11P51784 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USP11P51784 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP11P51784 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP11P51784 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP11P51784 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP11P51784 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP11P51784 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP11P51784 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP11P51784 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP11P51784 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP11P51784 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP11P51784 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP11P51784 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP11P51784 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP11P51784 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP11P51784 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP11P51784 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP11P51784 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP11P51784 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP11P51784 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP11P51784 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP11P51784 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP11P51784 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP11P51784 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP11P51784 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP11P51784 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP11P51784 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP11P51784 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP11P51784 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP11P51784 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP11P51784 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP11P51784 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP11P51784 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP11P51784 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
USP11P51784 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
USP11P51784 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP11P51784 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP11P51784 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP11P51784 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP11P51784 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP11P51784 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP11P51784 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP11P51784 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
USP11P51784 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP11P51784 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP11P51784 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP11P51784 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP11P51784 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP11P51784 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP11P51784 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP11P51784 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP11P51784 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms