Protein–RNA interactions for Protein: P50613

CDK7, Cyclin-dependent kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK7P50613 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK7P50613 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK7P50613 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK7P50613 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK7P50613 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK7P50613 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK7P50613 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK7P50613 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK7P50613 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK7P50613 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK7P50613 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK7P50613 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK7P50613 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK7P50613 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK7P50613 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK7P50613 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK7P50613 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK7P50613 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK7P50613 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK7P50613 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK7P50613 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK7P50613 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK7P50613 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK7P50613 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK7P50613 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK7P50613 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK7P50613 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK7P50613 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK7P50613 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK7P50613 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK7P50613 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK7P50613 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK7P50613 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK7P50613 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK7P50613 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK7P50613 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK7P50613 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK7P50613 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK7P50613 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK7P50613 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK7P50613 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK7P50613 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK7P50613 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK7P50613 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK7P50613 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK7P50613 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK7P50613 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK7P50613 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK7P50613 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK7P50613 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK7P50613 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK7P50613 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK7P50613 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK7P50613 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK7P50613 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK7P50613 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK7P50613 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK7P50613 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK7P50613 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK7P50613 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK7P50613 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK7P50613 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK7P50613 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK7P50613 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK7P50613 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK7P50613 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK7P50613 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK7P50613 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK7P50613 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK7P50613 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK7P50613 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK7P50613 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK7P50613 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK7P50613 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK7P50613 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK7P50613 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK7P50613 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK7P50613 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK7P50613 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK7P50613 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK7P50613 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK7P50613 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK7P50613 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK7P50613 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK7P50613 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK7P50613 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK7P50613 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK7P50613 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK7P50613 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK7P50613 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK7P50613 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK7P50613 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK7P50613 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK7P50613 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK7P50613 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK7P50613 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK7P50613 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK7P50613 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK7P50613 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK7P50613 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms