Protein–RNA interactions for Protein: P49914

MTHFS, 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFSP49914 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MTHFSP49914 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MTHFSP49914 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MTHFSP49914 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MTHFSP49914 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MTHFSP49914 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
MTHFSP49914 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MTHFSP49914 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MTHFSP49914 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MTHFSP49914 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MTHFSP49914 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MTHFSP49914 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MTHFSP49914 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MTHFSP49914 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MTHFSP49914 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MTHFSP49914 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MTHFSP49914 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MTHFSP49914 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MTHFSP49914 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
MTHFSP49914 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
MTHFSP49914 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTHFSP49914 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms