Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLK1P49759 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLK1P49759 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLK1P49759 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLK1P49759 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLK1P49759 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLK1P49759 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLK1P49759 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CLK1P49759 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLK1P49759 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLK1P49759 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLK1P49759 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLK1P49759 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLK1P49759 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLK1P49759 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLK1P49759 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLK1P49759 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLK1P49759 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLK1P49759 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLK1P49759 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLK1P49759 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLK1P49759 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLK1P49759 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLK1P49759 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CLK1P49759 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLK1P49759 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLK1P49759 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLK1P49759 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLK1P49759 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLK1P49759 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLK1P49759 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLK1P49759 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLK1P49759 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLK1P49759 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CLK1P49759 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLK1P49759 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLK1P49759 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLK1P49759 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLK1P49759 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLK1P49759 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CLK1P49759 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLK1P49759 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLK1P49759 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLK1P49759 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLK1P49759 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLK1P49759 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLK1P49759 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLK1P49759 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLK1P49759 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLK1P49759 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLK1P49759 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLK1P49759 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLK1P49759 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLK1P49759 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLK1P49759 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLK1P49759 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLK1P49759 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLK1P49759 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLK1P49759 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLK1P49759 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLK1P49759 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLK1P49759 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLK1P49759 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLK1P49759 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLK1P49759 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLK1P49759 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLK1P49759 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLK1P49759 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLK1P49759 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLK1P49759 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLK1P49759 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLK1P49759 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLK1P49759 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLK1P49759 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLK1P49759 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLK1P49759 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLK1P49759 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLK1P49759 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLK1P49759 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLK1P49759 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLK1P49759 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLK1P49759 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CLK1P49759 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLK1P49759 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLK1P49759 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLK1P49759 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CLK1P49759 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLK1P49759 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLK1P49759 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLK1P49759 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLK1P49759 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLK1P49759 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLK1P49759 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLK1P49759 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLK1P49759 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLK1P49759 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLK1P49759 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLK1P49759 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLK1P49759 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLK1P49759 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms