Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP4P49662 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP4P49662 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP4P49662 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP4P49662 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP4P49662 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP4P49662 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP4P49662 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP4P49662 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP4P49662 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP4P49662 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP4P49662 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP4P49662 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP4P49662 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP4P49662 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP4P49662 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP4P49662 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP4P49662 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP4P49662 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP4P49662 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP4P49662 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP4P49662 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP4P49662 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP4P49662 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP4P49662 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP4P49662 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP4P49662 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP4P49662 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP4P49662 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP4P49662 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP4P49662 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP4P49662 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP4P49662 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP4P49662 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP4P49662 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP4P49662 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP4P49662 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP4P49662 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP4P49662 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP4P49662 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP4P49662 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP4P49662 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP4P49662 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP4P49662 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP4P49662 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP4P49662 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP4P49662 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP4P49662 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP4P49662 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP4P49662 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP4P49662 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP4P49662 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP4P49662 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP4P49662 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP4P49662 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP4P49662 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP4P49662 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP4P49662 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP4P49662 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP4P49662 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP4P49662 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP4P49662 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP4P49662 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP4P49662 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP4P49662 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP4P49662 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP4P49662 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP4P49662 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP4P49662 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP4P49662 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP4P49662 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP4P49662 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP4P49662 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP4P49662 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP4P49662 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP4P49662 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP4P49662 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP4P49662 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP4P49662 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP4P49662 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP4P49662 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP4P49662 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP4P49662 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP4P49662 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP4P49662 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP4P49662 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP4P49662 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP4P49662 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP4P49662 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP4P49662 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP4P49662 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP4P49662 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP4P49662 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP4P49662 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP4P49662 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP4P49662 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP4P49662 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CASP4P49662 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CASP4P49662 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CASP4P49662 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms