Protein–RNA interactions for Protein: P48728

AMT, Aminomethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMTP48728 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMTP48728 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMTP48728 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMTP48728 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMTP48728 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMTP48728 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMTP48728 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMTP48728 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMTP48728 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMTP48728 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMTP48728 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMTP48728 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMTP48728 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMTP48728 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMTP48728 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMTP48728 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMTP48728 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMTP48728 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMTP48728 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMTP48728 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMTP48728 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMTP48728 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
AMTP48728 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMTP48728 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMTP48728 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
AMTP48728 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMTP48728 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMTP48728 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMTP48728 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMTP48728 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMTP48728 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AMTP48728 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMTP48728 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMTP48728 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AMTP48728 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMTP48728 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMTP48728 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMTP48728 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMTP48728 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMTP48728 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMTP48728 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMTP48728 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMTP48728 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMTP48728 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMTP48728 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMTP48728 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMTP48728 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMTP48728 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMTP48728 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMTP48728 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMTP48728 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMTP48728 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMTP48728 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AMTP48728 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMTP48728 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMTP48728 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMTP48728 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMTP48728 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMTP48728 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMTP48728 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMTP48728 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMTP48728 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMTP48728 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMTP48728 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMTP48728 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMTP48728 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMTP48728 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMTP48728 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMTP48728 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMTP48728 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMTP48728 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMTP48728 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMTP48728 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMTP48728 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMTP48728 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMTP48728 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMTP48728 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMTP48728 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMTP48728 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AMTP48728 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMTP48728 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMTP48728 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMTP48728 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMTP48728 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMTP48728 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AMTP48728 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AMTP48728 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AMTP48728 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AMTP48728 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AMTP48728 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AMTP48728 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AMTP48728 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AMTP48728 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AMTP48728 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AMTP48728 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AMTP48728 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AMTP48728 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AMTP48728 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
AMTP48728 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
AMTP48728 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms