Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TM4SF4P48230 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms