Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms