Protein–RNA interactions for Protein: P45379

TNNT2, Troponin T, cardiac muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT2P45379 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TNNT2P45379 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TNNT2P45379 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNNT2P45379 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNNT2P45379 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNNT2P45379 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNNT2P45379 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TNNT2P45379 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TNNT2P45379 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNNT2P45379 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNNT2P45379 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNNT2P45379 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNNT2P45379 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TNNT2P45379 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TNNT2P45379 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TNNT2P45379 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TNNT2P45379 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TNNT2P45379 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNNT2P45379 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TNNT2P45379 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNNT2P45379 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
TNNT2P45379 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TNNT2P45379 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNNT2P45379 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNNT2P45379 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TNNT2P45379 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TNNT2P45379 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNNT2P45379 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TNNT2P45379 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNNT2P45379 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNNT2P45379 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNNT2P45379 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TNNT2P45379 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TNNT2P45379 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNNT2P45379 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNNT2P45379 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TNNT2P45379 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TNNT2P45379 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TNNT2P45379 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNNT2P45379 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TNNT2P45379 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TNNT2P45379 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TNNT2P45379 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TNNT2P45379 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNNT2P45379 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNNT2P45379 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNNT2P45379 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TNNT2P45379 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TNNT2P45379 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNNT2P45379 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNNT2P45379 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNNT2P45379 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNNT2P45379 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNNT2P45379 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNNT2P45379 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNNT2P45379 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNNT2P45379 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNNT2P45379 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TNNT2P45379 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNNT2P45379 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNNT2P45379 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNNT2P45379 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNNT2P45379 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TNNT2P45379 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNNT2P45379 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNT2P45379 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNT2P45379 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNT2P45379 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNT2P45379 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNT2P45379 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNT2P45379 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNT2P45379 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNT2P45379 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNT2P45379 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNT2P45379 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNNT2P45379 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNNT2P45379 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNNT2P45379 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNNT2P45379 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNNT2P45379 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNNT2P45379 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNNT2P45379 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TNNT2P45379 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNNT2P45379 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNNT2P45379 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNNT2P45379 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNNT2P45379 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNNT2P45379 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNNT2P45379 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNNT2P45379 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNNT2P45379 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNNT2P45379 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNNT2P45379 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNNT2P45379 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNNT2P45379 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNNT2P45379 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNNT2P45379 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNNT2P45379 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNNT2P45379 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNNT2P45379 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms