Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNA4P43681 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNA4P43681 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNA4P43681 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNA4P43681 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNA4P43681 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNA4P43681 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNA4P43681 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNA4P43681 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNA4P43681 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNA4P43681 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNA4P43681 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNA4P43681 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms