Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPD2P43304 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPD2P43304 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPD2P43304 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPD2P43304 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPD2P43304 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPD2P43304 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPD2P43304 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPD2P43304 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPD2P43304 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPD2P43304 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPD2P43304 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPD2P43304 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPD2P43304 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPD2P43304 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPD2P43304 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPD2P43304 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPD2P43304 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPD2P43304 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPD2P43304 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPD2P43304 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPD2P43304 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPD2P43304 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPD2P43304 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPD2P43304 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GPD2P43304 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPD2P43304 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPD2P43304 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GPD2P43304 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPD2P43304 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPD2P43304 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPD2P43304 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPD2P43304 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPD2P43304 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPD2P43304 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPD2P43304 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPD2P43304 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPD2P43304 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPD2P43304 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPD2P43304 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPD2P43304 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPD2P43304 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPD2P43304 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPD2P43304 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPD2P43304 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPD2P43304 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPD2P43304 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPD2P43304 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPD2P43304 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPD2P43304 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPD2P43304 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPD2P43304 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GPD2P43304 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPD2P43304 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPD2P43304 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPD2P43304 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPD2P43304 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPD2P43304 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPD2P43304 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPD2P43304 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPD2P43304 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPD2P43304 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GPD2P43304 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GPD2P43304 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPD2P43304 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GPD2P43304 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPD2P43304 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPD2P43304 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPD2P43304 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPD2P43304 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPD2P43304 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPD2P43304 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPD2P43304 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GPD2P43304 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GPD2P43304 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GPD2P43304 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GPD2P43304 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GPD2P43304 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPD2P43304 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPD2P43304 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GPD2P43304 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPD2P43304 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPD2P43304 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPD2P43304 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPD2P43304 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPD2P43304 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPD2P43304 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPD2P43304 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GPD2P43304 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPD2P43304 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPD2P43304 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPD2P43304 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPD2P43304 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPD2P43304 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPD2P43304 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPD2P43304 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPD2P43304 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPD2P43304 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPD2P43304 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GPD2P43304 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.5 ms