Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.33■■□□□ 1
MTHFRP42898 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MTHFRP42898 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
MTHFRP42898 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MTHFRP42898 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTHFRP42898 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTHFRP42898 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTHFRP42898 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTHFRP42898 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTHFRP42898 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTHFRP42898 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MTHFRP42898 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MTHFRP42898 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTHFRP42898 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTHFRP42898 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MTHFRP42898 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MTHFRP42898 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTHFRP42898 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTHFRP42898 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MTHFRP42898 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTHFRP42898 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTHFRP42898 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTHFRP42898 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MTHFRP42898 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MTHFRP42898 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTHFRP42898 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTHFRP42898 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MTHFRP42898 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTHFRP42898 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTHFRP42898 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTHFRP42898 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
MTHFRP42898 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTHFRP42898 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTHFRP42898 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTHFRP42898 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTHFRP42898 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MTHFRP42898 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTHFRP42898 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
MTHFRP42898 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTHFRP42898 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTHFRP42898 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MTHFRP42898 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTHFRP42898 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MTHFRP42898 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTHFRP42898 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MTHFRP42898 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTHFRP42898 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTHFRP42898 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTHFRP42898 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTHFRP42898 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
MTHFRP42898 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTHFRP42898 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MTHFRP42898 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MTHFRP42898 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MTHFRP42898 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTHFRP42898 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MTHFRP42898 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTHFRP42898 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MTHFRP42898 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MTHFRP42898 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MTHFRP42898 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MTHFRP42898 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MTHFRP42898 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MTHFRP42898 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MTHFRP42898 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTHFRP42898 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTHFRP42898 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MTHFRP42898 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MTHFRP42898 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTHFRP42898 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTHFRP42898 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTHFRP42898 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTHFRP42898 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MTHFRP42898 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTHFRP42898 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTHFRP42898 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTHFRP42898 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MTHFRP42898 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MTHFRP42898 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MTHFRP42898 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTHFRP42898 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MTHFRP42898 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MTHFRP42898 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTHFRP42898 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTHFRP42898 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTHFRP42898 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTHFRP42898 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MTHFRP42898 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTHFRP42898 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MTHFRP42898 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTHFRP42898 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MTHFRP42898 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MTHFRP42898 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MTHFRP42898 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTHFRP42898 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MTHFRP42898 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTHFRP42898 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTHFRP42898 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MTHFRP42898 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTHFRP42898 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms