Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMPOP42166 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMPOP42166 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMPOP42166 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMPOP42166 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TMPOP42166 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMPOP42166 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMPOP42166 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMPOP42166 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMPOP42166 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMPOP42166 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMPOP42166 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMPOP42166 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMPOP42166 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMPOP42166 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMPOP42166 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMPOP42166 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMPOP42166 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMPOP42166 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMPOP42166 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMPOP42166 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMPOP42166 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMPOP42166 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMPOP42166 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMPOP42166 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMPOP42166 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMPOP42166 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMPOP42166 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMPOP42166 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMPOP42166 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMPOP42166 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMPOP42166 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMPOP42166 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMPOP42166 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMPOP42166 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMPOP42166 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMPOP42166 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TMPOP42166 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMPOP42166 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMPOP42166 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMPOP42166 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMPOP42166 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMPOP42166 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMPOP42166 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMPOP42166 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMPOP42166 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMPOP42166 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMPOP42166 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMPOP42166 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMPOP42166 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMPOP42166 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMPOP42166 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMPOP42166 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TMPOP42166 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMPOP42166 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMPOP42166 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMPOP42166 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMPOP42166 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMPOP42166 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMPOP42166 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMPOP42166 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TMPOP42166 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMPOP42166 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMPOP42166 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMPOP42166 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMPOP42166 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMPOP42166 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMPOP42166 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMPOP42166 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMPOP42166 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMPOP42166 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMPOP42166 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMPOP42166 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMPOP42166 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMPOP42166 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMPOP42166 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMPOP42166 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMPOP42166 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMPOP42166 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMPOP42166 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TMPOP42166 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMPOP42166 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
TMPOP42166 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMPOP42166 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMPOP42166 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMPOP42166 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMPOP42166 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMPOP42166 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMPOP42166 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMPOP42166 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMPOP42166 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMPOP42166 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TMPOP42166 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TMPOP42166 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMPOP42166 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMPOP42166 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMPOP42166 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMPOP42166 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMPOP42166 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMPOP42166 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms